戊二醛用于消毒、制藥、鞣革，用作電子顯微鏡及彩色顯像管的堅膜劑。該品用來生產興奮藥山梗菜堿-鹽。戊二醛是一種、廣譜的化學滅菌劑，在常溫下低濃度的戊二醛水溶液即可對許多微生物表現出活性，對繁殖型的-，-，分枝、致病性霉菌和-芽孢有高度滅菌效果，且對人毒性很低，有人稱本世紀初使用甲醛，30年代使用等化學殺菌消毒劑，戊二醛是第三個-。
戊二醛被譽為繼甲醛和消毒之后化學消毒滅菌劑發展的第三個-。作為生產戊二醛系列殺菌劑的原液，戊二醛(111-30-8)系列殺菌劑具有含量低，無致歧變、無積毒的特點，廣泛用于消毒滅菌、制藥等行業.
分數為2%的戊二醛殺滅-和芽孢的活性與8%的甲醛相仿，分數為2.5%的緩沖戊二醛用于內窺鏡的滅菌在15min 內可殺菌綠膿，而分數為70%的-則沒有效果。與氯相比，同樣用200mg/l 的水溶液浸泡家禽飼養器具，氯只能殺滅90%的-，而戊二醛的殺滅率為99.9%。對某些-比次氯酸鹽的殺菌效果要好。(3)殺菌迅速。分數為2%戊二醛可在2min內殺滅
-繁殖體，5min破壞表面抗原，5min~10min內殺滅-和-，10min~45min內殺滅菌
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