各穴孔填充程度要均勻一致，否則基較少的穴孔干燥的速度比較快，從而使水分管理不均衡； 播瓜類等大粒種子的穴孔基質不可太滿；
避免擠壓基質，否則會影響基質的透氣性和干燥速度，而且由于基質壓得過緊，種子會反彈，導致種子終發芽時深淺不一。
播種后初次澆水：
兩個選擇方案：種子在苗床上萌發，要先澆少量的水，待穴盤全部移至苗床后，再澆一下次透水。若種子在催芽室或簡易催芽空間草苫覆蓋保濕后，那么在進入催芽室之前要澆透水。建議用霧化噴頭或噴水細密的噴頭。
節省育苗場地和降低成本。用穴盤播種，讓小苗在穴盤里生長，長大后再移入育苗缽、或開溝分苗、或定植；在育苗盤里播種，把籽苗移入穴盤，長大后再移入育苗缽、或開溝分苗、或定植；這樣開始占地少，尤其適于在早春溫度低時培育小苗，外界溫度升高后再移入其他保護地培育成苗，可減少加溫費用。如果不用較大的苗定植，可直接用穴盤苗栽培。
便于規范化操作。可以采用機器播種，育苗盤可孵化蠶蛹，適宜工廠化大量育苗，省工、省力、，白菜育苗盤，我國目前工廠化育苗都采用穴盤。
育苗穴盤的穴孔形狀主要有方形和圓形，方形穴孔所含基質一般要比圓形穴孔多30%左右，水分分布亦較均勻，種苗根系發育充分
播種：將種子點在壓好穴的盤中，每穴一粒，避免漏播，水稻育苗盤，發芽率偏低的種子每穴播2粒。
覆蓋基質：播種后用蛭石覆蓋穴盤，方法是將蛭石倒在穴盤上，用刮板從穴盤的一方刮向另一方，去掉多余的蛭石，覆蓋蛭石不要過厚，與格室相平為宜。
育苗盤節省種子用量，降低生產成本。出苗整齊，育苗盤，保持植物種苗生長的一致性，能與各種手動及自動播種機配套使用，便于集中管理，提高工作效率。移栽時不損傷根系，緩苗迅速，成活率高。
播種后初次澆水：
兩個選擇方案：種子在苗床上萌發，要先澆少量的水，待穴盤全部移至苗床后，再澆一下次透水。若種子在催芽室或簡易催芽空間草苫覆蓋保濕后，那么在進入催芽室之前要澆透水。建議用霧化噴頭或噴水細密的噴頭。
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