PRIMER PREMIER PCR引物設計軟件

北京天演融智軟件有限公司為您提供primer premier pcr引物設計軟件。primer premier pcr引物設計軟件
標準pcr分析的引物設計
primer premier是設計和分析pcr引物的zui全面的軟件。primer premier通過利用zui接近的熱力學算法和zui---的熔化溫度，找到zui優的pcr、多重和snp基因分型引物。引物被篩選的二級結構、二聚體、發夾、同源性和物理性質，然后報告zui佳的序列，按順序排列。配備了一個方便的計算器，您可以很容易地操作序列并分析您的引物設計的結果。從ncbi加載感興趣的基因，選擇一個搜索范圍，讓primer premier為您挑選zui好的引物。

snp基因型分析的引物設計
使用primer premier，您可以從dbsnp加載序列，并將所設計的引物并置在snp選定的兩側。數百個未發表的snps也可以通過在標準genbank/ dbsnp文件中zhi定它們作為變體特性來加載。在zhi定snps之后，引物設計可以增強他們使用probe-based化學檢測。
多重檢測
對于多重實驗，primer premier可以讓您在批處理模式下啟動引物搜索，然后檢查設計的引物的交叉反應性，從而減少錯誤啟動。

自動同源性和避免模板結構
primer premier自動解釋blast搜索結果，并避免那些區域設計與數據庫具有---交叉同源性的引物。這些同源區域在序列視圖中被---顯示，并且在引物搜索期間被避免了。由于在擴展溫度下存在模板結構，可能會阻礙引物的擴展。為了避免所有這些區域的模板自動折疊，在您zhi定的折疊溫度下，程序使用專有算法來檢查模板內可能的二級結構。在序列視圖中，二級結構形成的區域下面用橫線強調，并在設計引物時被避免。避免同源區域使得寡聚物高度特---，避免模板結構提高設計引物的效率。
手動引物搜索
primer premier為用戶提供對引物設計的完全控制。使用手動搜索選項，用戶可以選擇模板序列上的任何位置來設計感測或反義引物。primer premier會立即計算并顯示新引物的性能。然后在主窗口的序列視圖中顯示由用戶zui終選擇的引物。

編輯模板序列
模板序列是可編輯的，可以由用戶來更改。可以使用標準的剪切---粘貼來進行修改。通過使用delete按鈕可以刪除不需要的序列區域。用戶可以---或注釋一個序列并保存它們以備將來參考。
功能特征
新改進的搜索算法
自動順序檢索
自動同源和模板結構避免
評估預先設計引物
手動引物搜索
編輯模板序列
序列瀏覽
生成報告
本地/桌面搜索功能選項
計算器
數據/數據庫管理
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