水質的穩定在很大程度上依賴微生態系統的穩定。微生態系統的穩定主要表現在以下幾個方面：1、能夠適應短時間的外部變化的壓力，保持自身生存的能力并保持系統集體性狀的完整性；2、對環境壓力具有抵抗性和修補能力。環境壓力沒有超過一定范圍時，系統可以抵抗這種壓力保持穩定，如果環境壓力超過其可抵抗的范圍，由于某些微生物類群的或失去活性，系統的部分功能喪失，此時系統的剩余部分又可與新出現的類群組成一個完整的生態系統，即進行修補；3、可根據環境的變化做出適應性調整，如跟隨季節變化的周期性調整。穩定性和微生物的多樣化有關，一個穩定的系統，其微生物的種類表現出高度的多樣性，不會因為個別種群的變化影響整體結構。當微生物的種類達到某個程度，并形成相對均衡的結構，系統才能獲得比較高的穩定性。開缸后具體需要多長時間系統才能達到穩定很難說，也許一個月，也許幾個月，有的水族箱甚至長期處于不穩定狀態。影響系統穩定的因素很復雜，比較常見的是生物過濾系統薄弱，負荷能力不足，此外，-增加魚只數量或頻繁更換品種；飼喂不定時不定量；不及時換水；過度清洗濾材；過濾器時開時停；以及-在缸內用藥等不當的做法，都會妨礙系統的穩定性，甚至造成系統的崩潰。
藻類結晶鹽的清除：水族箱飼養魚類不可避免地會有藻類存在，適量的海藻有利于降低水中鹽的濃度，還可以為海水魚提供可口餌料，但是在不加以控制而導致大量滋生后，不但影響觀賞效果，而且造成水質污染給魚類的生存造成-的威脅。為了避免這一現象，就要及時清除過多的藻類。用磁力式刮藻器每周清理一次，可-水族箱生態系統平衡運轉。剛設立的水族箱，易滋生茶褐色的硅藻，它們多附著于缸壁表面或珊瑚上，生態魚缸，可用海綿輕輕擦去，當硝化-繁殖穩定后，硅藻就會逐漸減少；當鹽濃度升高時，水族箱中還會出現紅褐色的粘稠狀海藻，雖然可以用手摘除，但這些方法并不能藻類，您需要找出藻類滋生的原因，判斷到底是餌料投喂過多、魚只密度太大、還是過濾器運轉情況不佳，使有機毒物積累過多，根據污染源采取措施，此外水族箱中飼養幾條食藻性海水魚，如青蛙魚等也可防止藻類滋生。在水族箱中時常會出現一種結晶狀的鹽巴，日久之后既會危害。
在天然海域，光線隨海水-的增加光照度也隨之變化，因而生活在不同水層的動物對光照有不同的需求。在海平面以下3米內的動物，屬日光帶動物，生活有海葵、蚌等；生活在海平面3～6米之間有管蟲等為中光帶動物；則生活在海平面6～10米之間的微光帶，像-。在水族箱中飼養海水魚時，要考慮創設不同光度的區域，以滿足各種生物的不同需求。根據飼養對象的不同，海水水族箱常用的照明設備有螢光燈、燈、金屬鹵素燈，飼養魚只選螢光燈，珊瑚造景缸則適宜燈照明，飼養多種軟體動物的水族箱使用金屬鹵素燈照明效果佳。螢光燈適宜為棲息在中光帶和微光帶的生物照明，安裝螢光燈時應盡可能裝在接近水面的地方才能發揮率，因而一般都安裝于水族箱頂蓋上，高淳魚缸，但螢光燈離水面太近，也會產生弊端，首先它所釋放的熱量只散布于水面，魚缸專賣店，其次鹽渣也會不斷滲入燈管，腐蝕底端，產生漏電的危險，因此安裝瑩光燈時要將燈管放入防水玻璃管中，并用硅膠密封兩端。此外，螢光燈的啟動單元，魚缸尺寸，好能單獨安裝在遠離水族箱的地方，以減少光線損失，防止產生過多熱量，還可避免缸蓋因過重而失去平衡。
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